Az Igazgatóság működési területén folyamatos problémát jelentenek a vízfolyásokba dőlő fák, amik lefolyás gátló akadályt képeznek csatornáinkon. Ezért a Szakaszmérnökség munkatársai a csatornaőr által észlelt és jelentett fákat a lehető legrövidebb időn belül eltávolítják a mederből.
A nagyobb egyedek eltávolítása komoly technikai hátteret igényel. Az eltávolítás folyamatát nehezíthetik a terepadottságok is. A kollégák az eltávolítás során partról és vízről is egyaránt dolgoznak. A kiemelt fákat a helyszíni darabolást követően a telephelyre szállítják.